El biólogo español Francisco Ayala es uno de los autores que más ha aportado a las críticas contra el movimiento neocreacionista del Diseño Inteligente. Ayala es muy efectivo en desmontar los argumentos de los neocreacionistas. La teoría del Diseño Inteligente postula que muchos rasgos biológicos no pudieron haber surgido vía selección natural, pues son irreductiblemente complejos (a saber, si les faltara un componente, el sistema colapsaría y dejaría de funcionar, en función de lo cual, en las fases previas de la evolución de ese rasgo, no habría ventaja adaptativa). Frente a los casos muchas veces invocados por los neocreacionistas (el ojo, el flagelo bacteriano), Ayala demuestra cómo sí pueden ser reducidos a rasgos más simples, y aún así, desempeñar alguna función, en vista de lo cual, sí tienen ventaja adaptativa.